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高通量测序(NGS)应用科普

浏览数量: 0     作者: 本站编辑     发布时间: 2022-03-22      来源: 本站

高通量测序技术在肿瘤基因检测中应用广泛。一方面通过基因测序可以找出癌症的突变基因,从而迅速确定对症药物;另一方面,样本类型可以是患者的血液甚至唾液,无需传统的病理切片,减少诊断过程中对患者机体的损伤。下面我们来简单介绍NGS在肿瘤样本基因检测应用中的流程

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1、样本接收与质量控制

血浆样本要求:

用于ctDNA检测的血液采集量必须在8ml以上,使用专业的BunnyTubeTM游离DNA样本保存管室温保存运输到中心实验室。

肿瘤石蜡样本(FFPE)要求:

①整个福尔马林固化石蜡包埋组织蜡块;②组织大小>0.5*0.5cm,切出5-10张未染色处理过的石蜡组织,厚度2-5μm;③组织大小<0.5*0.5cm,需10-15张,制成切片或直接保存到1.5mlEP管内肿瘤细胞含量不低于10%,坏死组织不大于70% 。玻片盒上要标明姓名、出生日期和采集日期,常温保存即可。

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2、样本DNA提取与破碎

针对不同样本类型运用不同提取试剂盒,提取所需DNA,并通过超声波破碎方法,使大分子片段的DNA行成一定长度范围内的短序列片段。

3、文库构建与富集

文库构建:将提前准备好的接头添加到提取到的DNA片段中,然后通过DNA分选与纯化试剂盒,去除不符合要求的大、小DNA片段以及多余的接头及其他杂质。

文库富集:通过加入阻断寡核苷酸--分子杂交(加入探针与目标杂交捕获)--吸附探针(加入磁珠从而吸附探针)--磁沉降(用磁铁捕获目标片段,洗脱掉off-target片段),实现目标DNA片段的选择。

4、高通量测序

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5、生信分析与报告生成

样本数据下机后,计算中心根据不同实验项目的要求,对数据使用不同的分析,计算方法进行分析。再根据生信信息分析的结果生成一份具体的报告,以便医生解读。

兔牙生物科技产品专为NGS开发设计,广泛应用于肿瘤基因检测,产前筛查及宏基因组测序。

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关于兔牙生物科技:

南京兔牙生物科技有限公司致力于构建完善的生物工程核心技术平台,全力打造基因测序产品链和技术服务链,为客户提供基因诊断、分子诊断以及临床检测领域全方位一站式服务的解决方案。

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